Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12bG3X9I7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h12bG3X9I7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms