Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8220F6YKI2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms