Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20671F6TVX7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm20671F6TVX7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20671F6TVX7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20671F6TVX7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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