Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17430F6RSK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17430F6RSK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms