Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc146E9Q9F7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc146E9Q9F7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms