Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifit3bE9PV48 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifit3bE9PV48 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifit3bE9PV48 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms