Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU019823E9PUQ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AU019823E9PUQ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AU019823E9PUQ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms