Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Gm17333C6EQI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gm17333C6EQI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Gm17333C6EQI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm17333C6EQI3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm17333C6EQI3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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