Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rrn3B2RS91 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrn3B2RS91 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms