Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed5B2RPU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed5B2RPU8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms