Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem238A9JSM3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms