Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4dA7KBS4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4dA7KBS4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4dA7KBS4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms