Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc3A6H6S0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Herc3A6H6S0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms