Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc38A2VDH3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc38A2VDH3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc38A2VDH3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms