Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syndig1A2ANU3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms