Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gm5938A2AEN9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gm5938A2AEN9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gm5938A2AEN9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Gm5938A2AEN9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Gm5938A2AEN9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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Gm5938A2AEN9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Gm5938A2AEN9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5938A2AEN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Gm5938A2AEN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Gm5938A2AEN9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Gm5938A2AEN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5938A2AEN9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms