Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms