Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms