Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSH0

1700031M16Rik, RIKEN cDNA 1700031M16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700031M16RikA0A087WSH0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700031M16RikA0A087WSH0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700031M16RikA0A087WSH0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
1700031M16RikA0A087WSH0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700031M16RikA0A087WSH0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700031M16RikA0A087WSH0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms