Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt27Q9Z320 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt27Q9Z320 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt27Q9Z320 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms