Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Knop1Q9Z2Q2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Knop1Q9Z2Q2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knop1Q9Z2Q2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms