Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mbd3Q9Z2D8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mbd3Q9Z2D8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mbd3Q9Z2D8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms