Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shcbp1Q9Z179 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms