Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms