Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcsQ9WU84 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcsQ9WU84 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 976.9 ms