Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ubxn8Q9QZ49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn8Q9QZ49 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 627.6 ms