Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11aQ9QYE3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11aQ9QYE3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms