Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VapbQ9QY76 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms