Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cml5Q9QXS8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cml5Q9QXS8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms