Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dkk3Q9QUN9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dkk3Q9QUN9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms