Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edf1Q9JMG1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Edf1Q9JMG1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edf1Q9JMG1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms