Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Bco1Q9JJS6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Bco1Q9JJS6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Bco1Q9JJS6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Bco1Q9JJS6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Bco1Q9JJS6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Bco1Q9JJS6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco1Q9JJS6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Bco1Q9JJS6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Bco1Q9JJS6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Bco1Q9JJS6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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