Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ush1cQ9ES64 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ush1cQ9ES64 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms