Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst4Q9EQW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndst4Q9EQW8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndst4Q9EQW8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst4Q9EQW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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