Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prpf4Q9DAW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf4Q9DAW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms