Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf654Q9DAU9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf654Q9DAU9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Znf654Q9DAU9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf654Q9DAU9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf654Q9DAU9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf654Q9DAU9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf654Q9DAU9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf654Q9DAU9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms