Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifrd2Q9D8U0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd2Q9D8U0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ifrd2Q9D8U0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifrd2Q9D8U0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifrd2Q9D8U0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms