Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn9Q9D805 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn9Q9D805 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms