Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan17Q9D7W4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms