Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2dQ9D7M8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr2dQ9D7M8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms