Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stag1Q9D3E6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stag1Q9D3E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms