Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf1Q9D2H9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms