Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef12Q9D2F1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms