Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhdc8bQ9D2D9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc8bQ9D2D9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms