Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lsm12Q9D0R8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms