Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc96Q9CR92 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc96Q9CR92 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms