Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl20Q9CQL4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl20Q9CQL4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms