Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nipsnap3bQ9CQE1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms