Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim11Q99PQ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim11Q99PQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms