Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf34Q99KR6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rnf34Q99KR6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.5 ms